พิพิธภัณฑ์วัดคลองท่อมตั้งอยู่ที่ วัดคลองท่อม ภายในพิพิธภัณฑ์ วัตถุโบราณจำนวนมากมายที่ขุดค้นพบได้ในบริเวณที่เรียกว่า ควนลูกปัด ซึ่งอยู่ด้านหลังวัดคลองท่อม และเป็นแหล่งโบราณคดีที่สำคัญของประเทศ จากการสำรวจโดยกรมศิลปากร พบโบราณวัตถุจำนวนมาก เช่น เหรียญโลหะ เศษภาชนะดินเผา เครื่องประดับทำจากหิน แก้ว สำริด ทองคำ ฯลฯ เมื่อไปเที่ยวพิพิธภัณฑ์แห่งนี้ จะได้ชมความเจริญรุ่งเรืองในอดีตของเมืองกระบี่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งลูกปัดอันเป็นมรดกทางวัฒนธรรมที่เก่าแก่ของมนุษย์สมัยเมื่อ 5,000 ปีเศษมาแล้ว