ตามตำนานเล่าว่า วันหนึ่งมีพระพุทธรูปลอยน้ำมาติดที่ริมฝั่งคลองโอ่งอ่าง ซึ่งปัจจุบันเรียกว่า คลองบางลำพู ด้านตลาดนานา และไม่ยอมลอยไปที่อื่น ชาวบ้านละแวกนี้จึงพร้อมใจอัญเชิญขึ้นมาบูชา เมื่อประมาณ พ.ศ. 2503 ได้เกิดอัคคีภัยบริเวณตลาดทุเรียน (เดิม) ซึ่งปัจจุบันเรียกว่า ตลาดนวรัตน์ อยู่ฝั่งตรงที่ตั้งศาลเจ้าพ่อหนูในปัจจุบัน มีชาวบ้านเห็นเด็กผู้ชายแต่งกายชุดสีชมพูยืนโบกธงอยู่ในลักษณะปัดเป่า ทำให้อัคคีภัยสงบลง เข้าใจว่าเด็กชายดังกล่าวเป็นเทพยดา ชาวบ้านจึงพร้อมใจกันขนานนามพระพุทธรูปนี้ว่า เจ้าพ่อหนู (คำว่า หนู เป็นคำเรียกเด็ก) นับแต่นั้น