เดิมแต่ก่อนมาเป็นคลองส่งน้ำธรรมชาติ แต่มีตอไม้มาก เป็นคลองเล็กๆ เรียกกันมาตั้งแต่บรรพบุรุษ มีน้ำเค็มตลอดทั้งปี แต่เดิมสามารถทำนาเกลือ ปัจจุบันมีการพัฒนามาทำเป็นนากุ้ง เลี้ยงหอยแครง บนพื้นลาดในนากุ้งและเลี้ยงปู ควบคู่กันไป คลองแสนตอยังเชื่อมกับคลองสายหลัก คือ คลองพิทยาลงกรณ์ ซึ่งไปเชื่อมต่อกับคลองขุนราชพินิจใจ ซึ่งเป็นเส้นทางออกสู่ทะเลกรุงเทพมหานคร ซึ่งจะได้เห็นหลักเขตที่ 28 จุดเชื่อมระหว่างจังหวัดสมุทรปราการ และกรุงเทพมหานคร