ศูนย์วิจัยยางหนองคาย เริ่มเปิดเป็นทางการตั้งแต่วันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ. 2531 โดยใช้ชื่อหน่วยงานว่า สถานีทดลองยางหนองคาย โดยเป็นสถานีทดลองยางในเครือข่ายของ ศูนย์วิจัยยางฉะเชิงเทรา สังกัดสถาบันวิจัยยาง กรมวิชาการเกษตร ต่อมาได้รับการยกระดับขึ้นเป็น ศูนย์วิจัยยางหนองคาย โดยมีพิธีเปิดอย่างเป็นทางการในวันที่ 17 มกราคม พ.ศ. 2539 ต่อมาในปี 2546-2551 มีการปรับโครงสร้างใหม่ของกรมวิชาการเกษตร ศูนย์วิจัยยางหนองคาย จึงได้ปรับให้อยู่ในสังกัดของสำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรเขตที่ 3 จังหวัดขอนแก่น และในปี 2552 จนถึงปัจจุบัน ได้มีการปรับสู่สังกัดเดิมคือ สถาบันวิจัย ยางทั้งนี้ภายในได้จัดเป็นแหล่งท่องเที่ยวเชิงเกษตร ให้คนทั่วไปได้เยี่ยมชม
เป็นศูนย์บริการข้อมูลวิชาการ และบริการถ่ายทอดเทคโนโลยีต่างๆ ให้แก่เกษตรกรและเจ้าหน้าที่ของหน่วยงาน