หาดคลองเจ้า อยู่ทางตะวันตกของเกาะถัดจากอ่าวตะเภาลงมาทางใต้ประมาณ 1 กิโลเมตร ตัวหาดซึ่งเป็นที่ตั้งของชุมชนบ้านคลองเจ้า หาดคลองเจ้าเป็นหาดทรายขาวน้ำทะเลใสร่มรื่นในทิวมะพร้าว ทางตอนใต้เป็นปากคลองเจ้าที่ไหลมาจากน้ำตกคลองเจ้ามีปาโกงกางขึ้นอยู่หนาแน่น หาดคลองเจ้าเป็นอีกหนึ่งชายหาดยอดนิยมของเกาะกูดจากทรายที่ขาวเนียนนุ่มละมุนเท้า น้ำทะเลใสสีฟ้ายามแสงแดดส่องกระทบและลำคลองเจ้าที่คดเคี้ยวเข้าไปภายในแผ่นดินจนถึงน้ำตกคลองเจ้า ณ ชายหาดแห่งนี้มีที่พักคุณภาพดีราคาประหยัดจำนวนหลายรีสอร์ท โดยมีกิจกรรมการท่องเที่ยวหลายอย่าง เช่น พายเรือคายักพายซึ่งนักท่องเที่ยวสามารถพายเรือเข้าไปถึงน้ำตกคลองเจ้าได้ มีจักรยานยนต์เช่าสำหรับขี่รอบเกาะจำนวนมาก เป็นต้น